أنشئ مصرف شنقيط بناءً علي الاتفاقية الموقعة في انواكشوط بتاريخ 8 جمادي الأولي 1392 هـ، الموافق 1972/06/20 بين الجمهورية الإسلامية الموريتانية والمصرف الليبي الخارجي لغرض توثيق الصِلات الاقتصادية بين البلدين الشقيقين ليبيا وموريتانيا حيث مثل معلمة بارزة من معالم الاقتصاد الموريتاني وساهم في توفير المناخ الملائم لاتخاذ أهم قرار اقتصادي في موريتانيا ألا وهو إنشاء العملة المحلية وساهم بفاعلية واقتدار في تعزيز الاستقلال السياسي والاقتصادي.

كما استطاع المصرف بفضل دعم مساهميه القيام بالدور الرئيسي لدعم الاقتصاد الموريتاني من خلال الاستمرار في تمويل إحتياجات القطاعات الاقتصادية وفتح الاعتمادات وتنفيذ الحوالات التي لا غنى عنها لإسعاد المواطن والنهوض بالاقتصاد وبذلك شكل ويشكل ركناً هاماً من أركان الاقتصاد الوطني الموريتاني ورمزاً مضيئاً للتعاون العربي العربي، وهو اليوم يواصل نشاطه بثقة واقتدار تحقيقاً للأهداف التي أنشئ من أجلها.

هذا ويبلغ رأسمال المصرف حالياً مبلغ 1 مليار أوقية ما يعادل 27.5 مليون دولار أمريكي منها 66% للمساهم الليبي(المصرف الليبي الخارجي) و 34% للمساهم الموريتاني(وزارة المالية الموريتانية).